首先完成了原始nnUNetV2和EAB-nnUNetV2的全部五折100e训练。
之后按照官方的指南：
Automatically determine the best configuration
Once the desired configurations were trained (full cross-validation) you can tell nnU-Net to automatically identify
the best combination for you:
1nnUNetv2_find_best_configuration DATASET_NAME_OR_ID -c CONFIGURATIONS
CONFIGURATIONS hereby is the list of configurations you would like to explore. Per default, ensembling is enabled
meaning that nnU-Net will generate all possible combinations of ensem ...
这些条目属于医学影像分析领域的特征提取，通常用于放射组学分析。其中，“diagnostics_”开头的条目表示诊断信息，“original_”开头的条目表示原始影像特征。以下是对这些条目的解释：
Diagnostics 诊断信息
diagnostics_Versions_PyRadiomics
PyRadiomics版本信息，用于标识所使用的PyRadiomics库版本。
diagnostics_Versions_Numpy
Numpy版本信息，用于标识所使用的Numpy库版本。
diagnostics_Versions_SimpleITK
SimpleITK版本信息，用于标识所使用的SimpleITK库版本。
diagnostics_Versions_PyWavelet
PyWavelet版本信息，用于标识所使用的PyWavelet库版本。
diagnostics_Versions_Python
Python版本信息，用于标识所使用的Python版本。
diagnostics_Configuration_Settings
PyRadiomics配置设置，列出 ...
Pyradiomics是一个专为从医学影像中提取放射组学特征而开发的开源Python包。该软件包的开发者致力于设立放射组学分析的参考标准，同时提供一个经过验证且持续维护的开放平台，以便于放射组学特征的简易与可重现性提取。这一平台不仅提升了放射组学能力的认知度，也促进了相关领域社群的壮大。它具备处理2D和3D图像的能力，能够针对感兴趣区域计算单一特征值（被称为“基于分割”的方法），或是生成特征图（即“基于体素”的方法）。
一、图像类型
在使用 pyradiomics 包进行图像特征提取时，可以选择多种图像类型来提取特征。这些图像类型包括原始图像以及应用了各种滤波器处理后的图像。以下是一些常用的图像类型及其对应的滤波器，这些滤波器可以帮助提取不同层次的图像特征：
图像类型
描述
Original
原始图像，没有经过任何额外处理的图像。
Wavelet
小波变换图像，这种变换产生8种不同的频带图像（LLH、LHL、LHH、HLL、HLH、HHL、HHH、LLL），用于捕获图像的多尺度和多方向特征。
LoG
Laplacian of Gaussian (高斯拉普拉斯滤波 ...
基于pyradiomics影像组学特征提取
tags: [影像组学, 特征提取, 深度学习, 医学影像]
基于pyradiomics影像组学特征提取
特征提取：
1 pyradiomics的使用：
1.1，在python环境下安装pyradiomics:
1.2,设置特征提取器，获得想要特征：
1.2.1 图像类型
1.2.2 目标特征设置
1.2.3 特征提取器设置
2 代码示例;
参考：
特征提取：
在这里，我们使用pyradiomics来提取影像组学特征。首先，我们先介绍pyradiomica工具包，然后我们进行特征的提取。
1 pyradiomics的使用：
PyRadiomics的官方文档:https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/
1.1，在python环境下安装pyradiomics:
1pip install pyradiomics
1.2,设置特征提取器，获得想要特征：
通过自定义特征提取器，可以根据自己的需求来设置并提取特征。
其实，需要设置两个方面：1，图像类型；2，所要提取的特征； ...
nnUNetv2修改笔记
D1、今天开始修改nnUNetv2，以下是需要记录的东西。
从云龙那获得代码：
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748495051525354555657585960616263646566676869707172737475767778798081828384858687888990919293949596979899100101102103104105106107108109110111112113114115116117118119120121122123124125126127128129130131132133134135136137138139140141142143144145146147148149150151152plain_conv_encoder_EAB.pyimport torchfrom torch import nnimport numpy as npfrom typing import Unio ...
在 Linux 下，大家喜欢用 apt-get 来安装应用程序，如今在 windows 下，大家可以使用 Chocolatey 来快速下载搭建一个开发环境。
Chocolatey 的哲学就是完全用命令行来安装应用程序， 它更像一个包管理工具（背后使用 Nuget ）
另外需要说明的是， Chocolatey 只是把官方下载路径封装到了 Chocolatey 中，所以下载源都是其官方路径，所以下载的一定是合法的，但是如果原软件是需要 Licence 注册的话，那么 Chocolatey 下载安装好的软件还是需要你去购买注册。不过 Chocolatey 一般还是会选用免费 Licence 可用的软件。
Chocolatey官网 文档 具体可参考：官网也有教程哟
Requirements
1.打开自己电脑的powershell， 用管理员命令执行。
2、执行以下命令（复制官网的命令才成功的哟）：
1Set-ExecutionPolicy Bypass -Scope Process -Force; iex ((New-Object System.Net.WebClient).Dow ...
中国视角下的欧洲健康数据空间建设路径
H-Matrix [生命健康数据空间联合实验室]
生命健康数据空间联合实验室
微信号 gh_eaa896736a5f
功能介绍 实验室（H-Matrix Joint Lab）是健康数据要素产学研医用多方联动平台，旨在健全数据流通合作机制，推动数据要素跨境流通，创新数据要素产业生态，引领数据要素产业发展，促进未来健康产业创新应用，推动医疗健康数据要素产业创新高地建设。
2024-05-24 08:59 上海
摘要：本文从中国视角出发，全面分析了欧洲健康数据空间（EHDS）的建设背景、现状以及对中国健康数据空间建设的借鉴意义。随着数字化转型的加速，数据成为关键生产要素，欧盟于2020年提出《欧洲数据战略》，并在新冠肺炎疫情的挑战下，加速了EHDS的筹备工作。EHDS旨在创建统一法律环境，促进健康数据的跨境访问和交换，通过MyHealth@EU和HealthData@EU两大平台，分别支持健康数据的一次使用和二次使用。中国也在积极探索医疗健康大数据的开放共享，通过建立统一数据标准，推动医疗数据的整合与共享。H-Matrix项目作为国内首个健康数据空间项 ...
医疗数据要素市场体系构建的若干思考
H-Matrix [生命健康数据空间联合实验室]
生命健康数据空间联合实验室
微信号 gh_eaa896736a5f
功能介绍 实验室（H-Matrix Joint Lab）是健康数据要素产学研医用多方联动平台，旨在健全数据流通合作机制，推动数据要素跨境流通，创新数据要素产业生态，引领数据要素产业发展，促进未来健康产业创新应用，推动医疗健康数据要素产业创新高地建设。
2024-05-30 09:37 上海
引言：随着数字经济的蓬勃发展，医疗数据作为关键的生产要素，其价值和潜力正日益受到重视。医疗数据不仅包含了患者的个人信息、医疗记录和诊断结果等敏感信息，还涉及到医疗行为的复杂性和多样性。如何安全、高效地构建医疗数据要素市场体系，成为促进医疗行业创新和发展的关键。本文将从理论基础、国际视角、我国现状与挑战、建构策略与路径以及市场体系的运行模式与机制等方面，对医疗数据要素市场体系的构建进行探讨，旨在为推动医疗数据的整合、共享和创新应用提供思路和策略。
一、医疗数据要素市场体系建构的理论基础
在探讨医疗数据要素市场体系建构的理论基础时，首先需要明确数据要 ...
windows11运行Docker Desktop，报错Docker Desktop -WSL update failed
详细报错信息：
Docker Desktop -WSL update failed An error occurred while updating WSL. You can restart Docker Desktop to try again or manually update using wsl --update. If the issue persists please collect diagnostics and submit an issue …😕/docs.docker.com/desktop/troubleshoot/overview/#diagnose-from-the-termin…
**解决方法一：**重新安装Docker Desktop，但是依然报错
解决方法二：
1.安装WSL2
使用命令：
1# 查看可安装的版本信息wsl --list --online
1# 安装对应版本 （Ubuntu-20.04 为下图 NAME）w ...
解决 Windows 10 端口被 Hyper-V 随机保留（占用）的问题
大概从半年前开始，我发现我的代理软件配置的端口有时会不能用，软件提示「没有权限访问端口」。这个问题会在什么时候出现完全随机，没有任何规律。对于这个问题，有时候重启可以解决，有时候重启好几次才能解决，并且如果运气不好，可能重启几次后这些端口还是不能用……
这让我非常困惑，我给代理软件开了管理员权限，但没有效果。我使用netstat -ano想看看这些端口被什么程序占用，却一无所获。当时，我误以为是代理软件出了一些神秘问题，在 google 无果后，因为大多数时候重启都能解决，我就没有再管。
直到前两天，我在做 Web 开发时，发现在Windows 10中使用localhost:8088死活访问不了 WSL 2 的8088端口。一开始我以为是WSL 2默认的端口转发出错了，便用netsh interface portproxy重新指定了端口转发，但还是访问不了。我又猜想可能是WSL 2中Ubuntu的防火墙规则有问题，但排查后发现不是。我又怀疑是Windows 10的防火墙设置有问题，但仔细核对后发现确实没有问题 ...
