训练感觉还是先把消融实验做完算了。最近在跑dc+mbtfe的。其他那些感觉也不重要,以前也有数据可以用。至于那个回归模型,一开始是这样的:昨天晚上直接是跑收敛了,收敛的有点吓人:(vscode里面的ts好糊,不知道是怎么显示的)直接跑到底了,R方都快到1了。结果试了下验证,哈哈:把验证集都处理了一下进行验证,结果是:只能说很符合预期。一开始只能验证29个我还以为是bug,后来一看排行榜上都这样。那就这样吧,看着指标和排行榜上的也没有什么太大的差别,那就可以继续做下去了。
会议下午开会,4个人有三个讲的一篇文章,有点难绷。牢蒋下周出差,又自由咯。不过下下周要验收成果,今晚上先把spring boot那部分发给小迪,让他搞吧。
训练今天继续训练消融实验。对比试验准备做一个3D UNet,一个TransBTS,STUNet,再加个mmformer感觉就差不多了。预后预测这方面,又改了下网络,做了一个每多少Epoch保存模型,然后继续训练的功能。这样需要保存优化器,所以模型大了不少。现在可以使用tensorboard了。然后增加了其他几个指标可以查看性能。先跑着,感觉是不收敛,很烦。
其他最近感觉好像学校里有些旅游团一样的。可能是有夏令营?听同学说有小学生来做哪种探险。也挺好的。不过今晚上菊园餐厅全关了。难受啊
训练跑UNet,有点复杂,不行就用以前用过的数据算了。
昨天把孙梓钊师兄的代码改了下,用之前的jpg和xml,然后把网络最后一层改成单输出,做回归。MSE损失直接爆炸,也没有啥变好的意思。
感觉有点爆炸。然后下了他们19年的论文,看着好像他们也就这样了这看着也是好几万。感觉不行的话还改成分类算了,改成分类20类。我看还有有论文写的直接分三类的。有点搞。
训练今天看了下加三个的,感觉成了啊下面是合并后的表格,以Markdown格式展示:
Model
Dice_ET
Dice_WT
Dice_TC
Sensitivity_ET
Sensitivity_WT
Sensitivity_TC
Specificity_ET
Specificity_WT
Specificity_TC
Hausdorff95_ET
Hausdorff95_WT
Hausdorff95_TC
plain-nnunet
0.73716
0.90297
0.38221
0.76966
0.9024
0.60403
0.99057
0.98712
0.95677
33.44588
7.47936
19.83174
eab-nnunet
0.74459
0.90641
0.39029
0.78645
0.90544
0.62394
0.99839
0.99518
0.96524
3.54292
4.54008
16.91987
DC
0.72449
0.90981
0.38356
0.77769
0.91199
0.60747
0.99862
0.9952 ...
训练今天结果终于出了,完啦。效果不咋样,另外为啥连STUNet也拉了。。。另外,这个DC是有问题的,我第一折跑了两三百。等等重跑第一折试试。应该不会有这么高。
Label
Dice_ET
Dice_WT
Dice_TC
Sensitivity_ET
Sensitivity_WT
Sensitivity_TC
Specificity_ET
Specificity_WT
Specificity_TC
Hausdorff95_ET
Hausdorff95_WT
Hausdorff95_TC
MTBFE+EAB
0.74036
0.90398
0.38318
0.77477
0.90025
0.60437
0.99866
0.99542
0.96539
3.56547
5.34296
17.09767
DC
0.72449
0.90981
0.38356
0.77769
0.91199
0.60747
0.99862
0.99525
0.96485
3.35156
4.27039
16.6727
STUNet-Base
0.73345
0.9033
0.38989
0.77 ...
训练今天依然在跑nnUNet+EAB+MBTFE+DC的模型。看着每折验证集评估感觉还挺好的。希望能出点好结果吧。在线验证依然是没反应,服了。
今天从权哲那得到了孙梓钊师兄的网络,做生存预测,实际就是分类。下了个BraTS20的数据集,然后把数据集nii根据分割文件,提取出每个mri序列肿瘤最大的6张图象。然后根据分割文件还有提供的csv文档,有样学样的创建了xml文件。放里面训练,这分类都这么猛的吗,准确率都这么高,有点吓人。另外,图还没画,今天一定要把图画了。随便跑跑这个,然后接着跑nnUNet吧。
训练今天在线验证也还是没反应。服了,然后发现我还没做标签重映射。所以把EAB+MBTFE、STUnetBase和DC的三个出结果的重新做了下映射上传上去了。希望能快点。
汇报周四要我们全部人汇报9月1号啥乱七八糟的,搞不明白。下午做了一下午PPT。晚上跟云龙一块讨论了下网络结构的问题,顺便把他的电脑硬盘换了。今天也就这样了。另外最近楼道里误入的鸟越来越多了。中午查了下应该叫灰椋鸟?楼里有人搞了点坚果,不会还想在楼道里养鸟吧?截至现在我应该抓到放了有六七只了。希望它们不要再往这里跑了,抓它们看它们也挺害怕的。不抓随便来个人就在撞玻璃,难搞哦。
新一周的周一,今天下大雨,上午好不容易跑过来,下午又被同门叫到实验室。下着雨本来准备走过来,但是看公交车刚好来了,就花了5毛钱坐公交车。下车时侯不知道他不按站下车,我就到实验楼前面那个路口站在下站口了,结果那个司机直接停车了。导致我多走一个路口,也还好吧。声基吃饭时候跟他聊天,好像公交司机对这个学校里的差事不是很满意,好像挣的比较少。我倒是很奇怪为啥暑假了他们还不放假。以后有空可以多支持他们的工作。刚到实验楼就在楼道里抓了个小鸟,放的时候看到保洁阿姨坐在那边休息,就跟她还有一个路过的同学聊了一下,这个鸟在我们实验楼楼道顶那个地方做了个窝,然后呢那个地方好像有个空隙,他们就可以跑进来,但是进来之后就出不去了。我这几星期已经放了好几只了。
到了实验室,几分钟就把他们的问题解决了。慧茹的🖊重新配对一下就好了,声基连不上服务器,先帮他把网段改成了192.168.1.1网段的,然后发现还是连不上,于是试了下我的电脑也是连不上。声基说他重启了一下服务器就连不上了。然后就跑到服务器跟前,发现是RDPWapper又被Windows Defender给GANK了。恢复后正常。
实验既然来都来了,看了下 ...
训练今天EAB+MBTFE弄好了,推理有点慢,搞了半上午。传到在线认证平台去了,但是一直pending,搞不好又得等好久?牢蒋今天要让我搞模态缺失的分割任务,仔细看了下,要不就修改网络,要不就生成缺失模态。感觉可以想着第二个方向做一做。目前就继续改我的代码吧。
训练EAB+MBTFE训练训练了两折多了,效果感觉还可以哦,第二折都跑到了0.82+了。
1FOLD_0
1FOLD_1
1FOLD_2
应该明天就能出结果了,看看效果如何。
这周又没开会,好像是报奖要答辩啥的。早上五点牢蒋在那点人,真抽象啊。












